Организации, специализирующиеся добычей нужных ископаемых, должны уплачивать НДПИ, также производить расчет земляного налога, что существенно наращивает объем издержек. Сокращение налоговой нагрузки может быть благодаря оптимизации НДПИ за счет внедрения более прибыльного метода учета расходов. НДПИ исчисляется исходя из методики определения количества добытых ископаемых (ст. 339 НК), оно может рассчитываться прямым методом с внедрением измерительных устройств; косвенным методом –  по имеющимся данным о содержании полезного ископаемого в извлекаемом сырье. Избранная методика должна применяться в течение всего срока работ по добыче, ее корректировка вероятна только при изменении технологии разработки недр.

Также налог на добычу нужных ископаемых рассчитывается зависимо от цены нужных ископаемых, которая может определяться одним из 3-х методов: зависимо от цен реализации без учета госсубвенций, сложившихся в определенный налоговый период;  зависимо от цен реализации на добытые ископаемые, сложившихся в определенный налоговый период; зависимо от расчетной цены добытых ископаемых, в которую врубаются прямые издержки – издержки, связанные с приведением минерального сырья в соответствие со эталонами, также косвенные издержки. Фактически предприятия, уплачивающие налог на добычу нужных ископаемых, вправе определять расчетную цена 2-мя способами, отличающимися порядком принятия к учету косвенных издержек. 1-ый из их представляет собой их рассредотачивание пропорционально отношению прямых расходов по добыче ископаемых к их совокупной сумме в рамках налогового периода; 2-ой – ведение отдельного налогового учета косвенных издержек, связанных и не связанных с добычей.  Исходя из величины данных издержек, относящихся и не относящихся к процессу добычи ископаемых, налогоплательщик получает возможность для варьирования показателем расчетной цены. Произведя анализ состава косвенных расходов и просчитав различные методы их рассредотачивания по обоим вариантам, предприятие может избрать более лучший из их и закрепить его в учетной политике. Чтоб оценить необходимость внедрения того либо другого метода, стоит разглядеть пример исчисления налоговой базы по НДПИ.

Допустим, что организация, уплачивающая налог на добычу нужных ископаемых, имеет последующие экономические характеристики: прямые издержки, связанные с добычей — 60000 рублей, не связанные с добычей – 56000 рублей; косвенные издержки, связанные с добычей — 20000 рублей; на первичную обработку – 30000 рублей; на вторичную обработку – 80000 рублей; общепроизводственные издержки – 70000 рублей.

Чтоб высчитать налог на добычу нужных ископаемых первым методом, нужно отыскать долю прямых издержек, относящихся к добыче, в общем объеме прямых  расходов: 60000: (60000+56000) = 0,52. Косвенные издержки для определения налоговой базы рассчитываются методом умножения общей суммы расходов данной категории на долю прямых издержек: (20000 + 30000 + 80000 + 70000) х 0,52 = 104000 рублей. Таким макаром, расчетная цена составляет 164000 рублей (104000+60000).

Для рассмотрения второго метода расчетов нужно произвести разделение косвенных расходов на первичную обработку на две группы: издержки, конкретно связанные с производственным процессом – 20000 рублей; общепроизводственные издержки – 10000 рублей. Толика прямых издержек, относящихся к добыче ископаемых, определяется аналогично первому варианту и составляет 0,52. Сумма косвенных издержек, включаемых в расчетную цена, рассчитывается по формуле: К1+К2*К, где К1 – косвенные издержки, относящиеся к добыче ископаемых; К2 – общепроизводственные расходы, подлежащие рассредотачиванию; К – толика прямых издержек. Расчет смотрится последующим образом: (20000 + 20000 + (10000 + 70000) x 0,52) = 81600 рублей. Косвенные расходы на вторичную обработку в вычислениях не участвуют, так как не имеют прямого отношения к процессу добычи. Расчетная цена нужных ископаемых в этом случае составит 141600 рублей (81600+60000).

Как видно из приведенного примера, применение второго метода расчетов уменьшает налоговую базу на 22400 рублей. Необходимо отметить, что данная методика подходит для тех компаний, которые занимаются добычей ископаемых не для их предстоящей реализации, а для использования в производстве каких-то товаров. Чтоб улучшить налог на полезные ископаемые этим методом, предприятию нужно организовать раздельный учет косвенных издержек, что востребует дополнительных трудозатрат. С другой стороны, его внедрение позволит избежать претензий налоговых органов, так как схема базирована не на законодательных пробелах, а на применении более сложного способа расчетов.